Það eru nokkrir mismunandi blettir sem hægt er að nota til að sjón og mynda DNA eftir að efnið hefur verið aðskilið með rafgreiningu á hlaupi. Meðal margra valkosta eru þessar fimm stofnar algengasta upphafið með etídíumbrómíði, sem er mest notað. Þegar unnið er með þetta ferli er mikilvægt að ekki aðeins þekkja muninn á stofnum heldur einnig áhættu sem fylgir því.
01 etídíumbrómíð
Etídíumbrómíð er líklega þekktasta litið sem notað er til að visualisere DNA. Þessi litarefni er hægt að nota í hlaupblöndunni, í rafskautsbúnaðinum eða að blettja hlaupið eftir að hún er keyrt. Molecules of the dye fylgja DNA strengjum og flúrljósa undir UV ljós, sem sýnir þér nákvæmlega hvar hljómsveitirnar eru innan hlaupsins. Þrátt fyrir þann kost, er galli þess að etídíumbrómíð er hugsanlegt krabbameinsvaldandi, svo það verður að meðhöndla með mikilli aðgát. Vegna hugsanlegra heilsufarslegra áhrifa á að vinna með þessa hlaup hefur verið að finna valkosti. 02 SYBR Gull
SYBR Gulllitur má nota til að blettdu tvöfalt eða einstrengið DNA, eða til að bletta RNA. SYBR Gold var eitt af fyrstu kostunum við etídíumbrómíð til að ná markaðnum og það er talið næmara en etídíumbrómíð. Dye sýnir 1000 sinnum meiri UV flúrljómun þegar það er bundið við kjarnsýrur. Það kemst síðan í gegnum þykk og háum prósentum agarósa gels og má nota í formaldehýð gel. Vegna þess að flúrljómun í óbundnu sameindinni er svo lágt er ekki þörf á eyðingu. Lyfjafræðir með leyfishafa hafa einnig (frá upphafi SYBR Gold) þróað og markaðssett SYBR Safe og SYBR Green sem eru öruggari valkostir við etídíumbrómíð.
03 SYBR Green
The SYBR Green I og II bletti (aftur, markaðssett með Molecular Probes) eru bjartsýni fyrir mismunandi tilgangi. Vegna þess að þau bindast DNA eru þau enn talin hugsanleg stökkbreytingar og vegna þess að þau ættu að meðhöndla með varúð. SYBR Green Ég er næmari til notkunar með tvístrengnu DNA, en SYBR Green II, hins vegar, er best til notkunar með einstrengdu DNA eða RNA. Eins og vinsæll Ethidium Bromide blettur, flæða þessi mjög viðkvæm blettur undir UV-ljósi. 04 SYBR Safe
SYBR Safe var hannað til að vera öruggari valkostur við etídíumbrómíð og önnur blettur á SYBR. Það er ekki talið hættulegt úrgang og má almennt farga með venjulegum fráveitukerfum (þ.e. niður í holræsi) vegna þess að eiturhrifaprófanir benda til þess að engin bráð eiturhrif séu til staðar. Prófun bendir einnig til að lítil eða engin eiturverkanir á erfðaefni séu á sýrlenskum Hamster Embryo (SHE) frumum, eitilfrumum úr mönnum, eitilfrumum í músum og í AMES prófinu. Stimpillinn er hægt að nota með bláu ljósi transilluminator sem veldur minni skaða á DNA sem sýnist og býður upp á betri skilvirkni til seinna klónun. 05 Eva Green
Eva Green er grænt blómstrandi litarefni sem hefur reynst hamla PCR í minna mæli en önnur litarefni. Þetta gerir það mjög gagnlegt fyrir forrit eins og magn rauntíma PCR. Það er líka góður kostur ef þú notar litla bræðslumark gels til að endurheimta DNA. Það er mjög stöðugt við háan hita og hefur mjög litla flúrljómun á eigin spýtur, en er mjög flúrljómun þegar hún er bundin við DNA. Einnig hefur verið sýnt fram á að Eva Green hafi mjög lítil eða engin frumudrepandi áhrif eða stökkbreytandi áhrif.