A líta á lítið truflandi RNA og notaðar í rannsóknum á erfðafræðilegri erfðafræði
siRNA, sem stendur fyrir lítið truflandi ribónukleinsýru, er flokkur tveggja manna strandaðra RNA sameinda. Það er stundum þekkt sem stutt truflun á RNA eða rifnun á RNA.
Áður en þú kemst að því hvað nákvæmlega siRNA er, þá er mikilvægt að þekkja virkni RNAs. Ribonucleic Acid (RNA) er kjarnsýra sem er til staðar í öllum lifandi frumum og virkar sem sendiboði sem leiðbeinir leiðbeiningum frá DNA til að stjórna myndun próteina (athugið: RNA frekar en DNA heldur einnig erfðaupplýsingum í sumum veirum).
Lítil truflandi RNA (siRNA) eru litlar stykki af tvöfalt strandaðri (ds) RNA, venjulega um 21 nukótíð langur, með 3 'yfirhengi (2 núkleótíð) í hvorri enda sem hægt er að nota til að "trufla" við þýðingu próteina með því að binda til og stuðla að niðurbroti sendiboða RNA (mRNA) við tiltekna röð.
Með því að koma í veg fyrir að siRNA hindrar framleiðslu á sérstökum próteinum byggist á núkleótíðstæðum samsvarandi mRNA þeirra. Ferlið er kallað RNA truflun (RNAi), og getur einnig verið vísað til siRNA þögn eða siRNA knockdown.
Þar sem þeir koma frá
siRNA er almennt talið hafa komið frá lengri þætti exogenous vaxandi eða upprunnið utanaðkomandi lífveru) RNA sem er tekið upp af frumunni og gengur undir frekari vinnslu.
RNA kemur oft frá vektorum , eins og vírusum eða transposons, og hefur reynst að gegna hlutverki í veirueyðandi varnarefni, niðurbroti af offramleiðdu mRNA eða mRNA, sem þýðingu hefur verið fellt af og koma í veg fyrir röskun á erfðafræðilegri DNA með transposons.
Hver siRNA strengur inniheldur 5 'fosfat hóp og 3' hýdroxýl (OH) hóp. Þau eru framleidd úr dsRNA eða hálsrennsli með RNA sem, eftir að þau eru komin inn í frumu, skiptist með RNase III-eins ensím, sem kallast Dicer , með því að nota RNase eða takmörkun ensím . SíRNA er síðan felld inn í fjölhverfa próteinflóku sem kallast RNAi-framkallað þögul flókið (RISC).
RISC "leitar út" viðeigandi mRNA mælingu, þar sem siRNA lokar síðan og talið er að antisense strengurinn beinir niðurbroti viðbótarstrengsins mRNA með því að nota blöndu af endó- og exonukleasa ensímum.
Læknis og lækninga
Þegar spendýrafrumur standa frammi fyrir tvístrengnu RNA eins og siRNA getur það mistekað það sem veiruafurð og byrjað ónæmissvörun. Að auki getur innleiðing siRNA valdið ófyrirséðri off-targeting þar sem einnig er hægt að ráðast á annað ógnandi prótein og slá það út.
Að kynna of mikið siRNA í líkamann getur leitt til ósértækra atburða vegna virkjunar meðfæddra ónæmissvörunar, en með möguleika á að slá hvert gen af áhuga hefur siRNAs möguleika á mörgum meðferðaraðgerðum.
Með efnafræðilegum breytingum á siRNA til að auka meðferðarfræðilega eiginleika þeirra, svo sem:
- aukin virkni
- aukin stöðugleiki í sermi og minni afmarkanir
- minnkað ónæmisvirkjun
Mörg sjúkdóma geta hugsanlega verið meðhöndluð með því að hamla genþrýsting. Þess vegna hefur hönnun tilbúinnar siRNA til lækninga notað orðið vinsælt markmið margra líffræðilegra fyrirtækja.
Nákvæm gagnagrunnur um allar slíkar breytingar á efnafræðilegum efnum er handvirkt meðhöndlað hjá siRNAmod, handvirkt meðhöndluð gagnasafn tilraunafræðilega fullgilt efnafræðilega breytt siRNAs.
Heimildir:
Tsai, CS Biomacromolecules: Inngangur að uppbyggingu, virkni og upplýsingatækni. Wiley-Liss, 2007.
Whitehead, KA; Dahlman, JE; Langer, RS; Anderson, DG (2011). "Silencing eða örvun? SiRNA Afhending og ónæmiskerfið". Árleg endurskoðun efna- og líffræðilegs verkfræði 2 : 77-96.
Alekseev OM, Richardson RT, Alekseev O, O'Rand MG (2009). "Greining á gennefnisprófum í HeLa frumum til að bregðast við ofþjöppun eða siRNA miðlaðri eyðingu NASP". Æxlunar líffræði og endakrínfræði: 45.