Af hverju er E. coli notað til að klóna gen

by Theresa Phillips

Fjölhæfur örvera með ótrúlega möguleika

Escherichia coli örveran hefur langa sögu um notkun í líftæknifyrirtækinu og er enn örveran sem er valin fyrir flestar genaklónunar tilraunir. Þó að E. coli sé þekktur fyrir almenna einstaklinginn fyrir smitandi eðli einstakra stofnana (0157: H7) eru fáir meðvitaðir um hversu fjölhæfur og gagnlegur E. coli er að erfðafræðilegum rannsóknum. Það eru nokkrar ástæður E. coli varð svo mikið notað og er enn sameiginlegur gestgjafi fyrir raðbrigða DNA.

01 Genetic Einfaldleiki

Bakteríur gera gagnlegar verkfæri til erfðafræðilegra rannsókna vegna tiltölulega lítið genamengis í samanburði við eukaryotes. E-coli frumur hafa aðeins um 4.400 gen, en erfðafræðilega verkefnið hefur ákveðið að menn innihalda u.þ.b. 30.000 gena. Einnig lifa bakteríur, þ.mt E. coli , allan ævi sína í haploid ástandi (með einum hópi unpaired litninga). Þess vegna er engin önnur sett af litningum til að hylja áhrif stökkbreytinga í próteinverkfræði tilraunum.

02 Vöxtur

Bakteríur vaxa yfirleitt miklu hraðar en flóknari lífverur. E. coli vex hratt á hraða einrar kynslóðar á tuttugu mínútum undir dæmigerðum vaxtarskilyrðum. Þetta gerir kleift að undirbúa tíðni (miðgildi til hámarksþéttleika) menningu á einni nóttu og erfðafræðileg niðurstöðum í einni klukkustund í stað nokkurra daga, mánuði eða ára. Hraðari vöxtur þýðir einnig betri framleiðslugetu þegar menningarheimum er notað í hreinsaðri gerjun .

03 Öryggi

E. coli er náttúrulega að finna í meltingarvegi manna og dýra þar sem það hjálpar til við að veita næringarefni (vítamín K og B12) til gestgjafans. Það eru margar mismunandi stofnar af E. coli sem geta valdið eiturefnum eða valdið mismunandi sýkingum ef þau eru tekin inn eða leyft að komast inn í aðra hluta líkamans. Þrátt fyrir slæmt orðspor einnar sérstakrar eitruðrar stofnunar (O157: H7) eru E. coli yfirleitt tiltölulega skaðleg ef þau eru meðhöndluð með sanngjörnu hreinlæti.

04 The E. Coli Genome er vel skilið

E. coli erfðamengi var fyrstur til að vera algjörlega röð (árið 1997). Þar af leiðandi er E. coli mest öruggur örveran. Ítarlegri þekkingu á próteinþekkingaraðferðum sínum gerir það auðveldara að nota tilraunir þar sem tjáning erlendra próteina og val á recombinants er nauðsynleg.

05 Geta verið gestgjafi erlendra DNA

Flestar erfðafræðilegu aðferðirnar voru þróaðir með því að nota þessa bakteríu og eru enn betri eða árangursríkar í E. coli en í öðrum örverum. Þess vegna er undirbúningur lögbærra frumna (frumur sem taka upp erlend DNA) ekki flókið. Umbrot með öðrum örverum eru oft minni árangri.

06 E Coli er auðvelt að sjá um

Vegna þess að það vex svo vel í mönnum, finnur E. coli auðvelt að vaxa þar sem menn geta unnið. Til dæmis:

Það er mest þægilegt við líkamshita. Þó 98,6 gráður gæti verið svolítið heitt fyrir fólk, þá er auðvelt að viðhalda hitastigi á rannsóknarstofu.
E. coli býr í munnþörmum, sem þýðir að það er ekki varalegt um matinn. Í grundvallaratriðum er það fús til að neyta hvers konar fyrirframgreiddan mat.
Það getur vaxið bæði loftháð og loftfirrt. Þannig getur það fjölgað í meltingarvegi manna eða dýra en jafn jafn hamingjusamur í petri disk eða flösku.

Hvernig E. Coli skiptir máli

E. Coli er ótrúlega fjölhæfur tól fyrir erfðaverkfræðinga; Þess vegna hefur það þegar búið til ótrúlegt úrval lyfja og tækni. Það hefur jafnvel, samkvæmt Popular Mechanics, orðið fyrsta frumgerðin fyrir líf tölvu: "Í breyttri E. coli" ritara, "þróað af Stanford University vísindamönnum í mars síðastliðnum stendur DNA strengur fyrir vír og ensím fyrir rafeindin. Mögulega er þetta skref í átt að því að byggja vinnandi tölvur í lifandi frumum sem hægt væri að forrita til að stjórna gen tjáningu í lífveru. " Slík feat gæti aðeins verið náð með því að nota lífveru sem er vel skilið, auðvelt að vinna með og geta endurtekið fljótt.